Zero son savaşta kaybolur ve Kara Şövalyeler mutlak olarak yenilir. Bunun üzerine Kara Şövalyeler'den bazıları esir alınır bazısı ise kaçmayı başarır. Zero yani Lelouch eski hatıraları silinmiş şekilde hayatına devam eder ve bu sırada aslında gerçek kardeşi olmayan Rollo, Leouch'u izlemek için görevlendirilir ve onunda Geass gücü vardır. Lelouch bir takım olaylar sonucu yeniden hafızasını kazanır ve C.C.'den aldığı Geass gücüyle tekrar Zero olarak Kara Şövalyeler'in başına geçerek Britanya'ya meydan okur.